（一）负责初级水产品生产环节的监管，对水产捕捞、养殖过程中的生产环境、渔业投入品及生产环节，按照水产品质量管理制度实施监督管理。
（二）开展水产品药物残留专项整治行动，对水产养殖中的渔药使用、渔药残留检测、水产苗种的质量实施监督管理。
（三）组织渔业环境质量监测、评价和管理。
（四）拟订渔业技术标准，实施渔业产品生产过程的标准化管理。
（五）组织实施渔业生产产品的质量监督、认证和管理。
（六）负责水产养殖环节食品安全信息的收集、分析、预测等工作。